| 平成23年5月 | 魚沼基幹病院（仮称）整備基本計画策定 |
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| 平成24年4月 |
一般財団法人新潟県地域医療推進機構設立、荒川正昭理事長就任 |
| 平成24年5月 |
病院建設着工 |
| 平成24年7月 | 指定管理者に一般財団法人新潟県地域医療推進機構指定 |
| 平成25年4月 |
内山聖病院長就任 |
| 平成27年3月 | 新潟県と魚沼基幹病院の管理に関する基本協定書締結 |
| 平成27年5月 | 病院竣工 |
| 平成27年6月 |
新潟大学地域医療教育センター・魚沼基幹病院開院 診療科31科、許可病床454床（一般400床・精神50床・感染4床） (稼働病床308床：一般254床・精神50床・感染4床) 地域救命救急センター 地域周産期母子医療センター開設 第二種感染症指定医療機関 救急告示病院（三次救急）等指定 動体追跡装置（放射線治療）導入 |
| 平成28年4月 | 臨床研修病院（協力型）指定 |
| 平成28年11月 | 西６病棟一部開棟（稼働病床328床：一般274床・精神50床・感染4床） |
| 平成29年1月 | キャノピー（正面玄関前屋根）竣工 |
| 平成29年3月 |
臨床研修病院（基幹型）指定 一般病棟７対１入院基本料に移行 |
| 平成29年4月 | 西６病棟一時閉鎖（稼働病床308床：一般254床・精神50床・感染4床） |
| 平成30年4月 | 診断群分類別包括評価（DPC）方式に変更 |
| 平成30年6月 | ３テスラMRI装置導入（MRI２台目） |
| 平成30年10月 | 臨床検査室の国際標準規格（ISO15189）認定 |
| 平成30年12月 | エイズ治療拠点病院指定 |
| 平成31年4月 | 西６病棟一部開棟（稼働病床356床：一般302床・精神50床・感染4床） |
| 令和元年11月 | Ｏ-armイメージングシステム導入 |
| 令和2年3月 |
内山聖病院長退任 |
| 令和2年4月 |
鈴木榮一病院長就任 腫瘍センター開設 |
| 令和2年6月 | 新型コロナウイルス感染症患者（疑い含む）受入協力医療機関指定 |
| 令和3年1月 | 難病医療協力病院（基幹型）指定 |
| 令和3年2月 |
西５病棟開棟（稼働病床405床：一般351床・精神50床・感染4床） 透析ベッド増床（21台→24台） |
| 令和3年3月 | 西７病棟増床（稼働病床416床：一般362床・精神50床・感染4床） |
| 令和3年4月 |
からだにやさしい治療センター開設 地域がん診療連携拠点病院指定 |